من النتائج الاستراتيجية والرئيسية لمعركة طوفان الأقصى أنها أسقطت الفكر الفتنوي والتحريضي الذي ساد المشهد خلال عشرية النار، لكن بقرار اختيار يحيى السنوار رئيساً لحركة حماس يُدفن هذا الفكر وتوأد الفتنة الطائفية والمذهبية بينما تندمج قوى المقاومة والوحدة والدم المشترك في خندق واحد ومصير واحد.